La "Matrícula" es el trámite mediante el cual un estudiante se inscribe oficialmente en la Universidad de Burgos y lo que le permite seguir los cursos o materias del plan de estudios que haya elegido. Una vez que su contrato de estudios ha sido firmado y aprobado por ambas instituciones, el Servicio de Relaciones Internacionales se ocupa de tramitar la matrícula en las asignaturas incluidas en el mismo. De esta forma, el estudiante tendrá acceso a todos los servicios de la UBU desde su llegada, incluido el préstamo de libros de la biblioteca y el acceso a la plataforma virtual de la UBU, UBUVirtual.
Una vez que el alumno se incorpora a las clases, dispondrá de un plazo de una semana para la modificación de la matrícula, siempre que su contrato de estudios haya sido modificado y aprobado por los coordinadores académicos de ambas universidades.