La Universidad de Burgos aprobó la creación de un Fondo de Cooperación al Desarrollo en la Junta de Gobierno celebrada el 16 de Diciembre de 2008. Desde entonces, se reciben donaciones económicas procedentes tanto de la comunidad universitaria como de otros colectivos interesados en colaborar . Los recursos que se aportan a una "caja común", se gestionan para dar cabida a la colaboración en proyectos de cooperación al desarrollo, así como prestar ayuda en situaciones de emergencia o apoyar iniciativas de sensibilización.
Este fondo surgió como iniciativa del Centro de Cooperación al Desarrollo y Acción Solidaria y de la Comisión de Cooperación al Desarrollo.
La página web de la universidad permite hacer donaciones directas por parte de todos los miembros de la comunidad universitaria y de cualquier otra persona interesada a este fondo.